Ааво Отс родился в Вастселийна и начал учиться игре на трубе под руководством Леонида Эрика. Он изучал игру на трубе и хоровое дирижирование в Музыкальной школе Хейно Эллера в Тарту и окончил Таллиннскую государственную консерваторию по специальности хоровое дирижирование в классе Густава Эрнесакса и Олева Оя и игре на трубе в классе Тыну Тарума. Он продолжил обучение игре на трубе в Ленинградской государственной консерватории.

Ааво Отс играл в оркестре театра "Эстония". До самой смерти он работал в Академии музыки и театрального искусства и Школе музыки и балета.

Более 30 лет Отс в качестве художественного руководителя организовывал международные дни духовой музыки, многочисленные мастер-классы, студенческие летние лагеря и концерты.

Ааво Отс дирижировал духовыми оркестрами на певческих праздниках и на студенческих певческих праздниках Gaudeamus, а также был руководителем духовых оркестров. Он является многократным лауреатом ежегодной премии Капитала культуры и несколько раз был назван Ассоциацией хоров Эстонии дирижером года. Награжден орденом Белой Звезды V степени.

Прощание с Ааво Отса состоится 16 июня в 11:00 в Яановой церкви в Таллинне.