В ведении Министерства культуры еще остаются пять государственных музеев, организационно-правовую форму которых министерство хотело бы изменить, но для этого было необходимо согласие Министерства финансов.

Еще в 2002 году Минкульт совместно с местными самоуправлениями учредил в виде фондов "Музеи Вирумаа" и "Музей Таммсааре в Варгамяэ", а с 2012 года продолжило реорганизацию музеев. В частности, в фонды были преобразованы некогда принадлежавшие государству Музей под открытым небом и Эстонский художественный музей.

В качестве заключительного этапа реформы государство хочет преобразовать в фонды Эстонский архитектурный музей, Музей прикладного искусства и дизайна, Приходской музей О. Лутса в Паламузе, Тартуский художественный музей и Вильяндиский музей.

В ответ на запрос Министерства культуры министр финансов Март Вырклаэв заявил, что преобразование музеев в фонды "открывает дверь для большей автономии и гибкости в планировании и реализации их программ деятельности и бюджетов".

"Статус фонда позволит музеям лучше адаптировать свою деятельность к быстро меняющимся потребностям и условиям рынка, обеспечивая тем самым более плавный и эффективный ход их деятельности", - счел Вырклаэв.

Он также поддержал объединение музеев, указав, что это может дать важный синергетический эффект.