Решение о регистрации Тартуский уездный суд принял 5 мая 2026 года. В правление общины помимо Ильдара Мухамедшина вошли Рифкат Гараев и Лия Махмутова.

Мухамедшин заявил, что регистрация общины является важным этапом в развитии исламской жизни в Эстонии и подтверждает право общины действовать открыто, законно и в соответствии со своими религиозными убеждениями, уставом и целями.

"Община является добровольным объединением мусульман, постоянно проживающих в Эстонии и исповедующих свою веру, которое действует под духовным руководством выбранного общиной муфтия и имамов", - добавил Мухамедшин.

По словам представителей общины, регистрация имеет не только юридическое значение, но и общественный вес, так как открывает возможности для дальнейшей системной и ответственной деятельности в духе уважения к обществу, государству и другим религиозным объединениям.

Община подчеркнула, что намерена строить свою дальнейшую деятельность на основе закона, в духе религиозной ответственности, с уважением к другим, ради мира, справедливости и общественного согласия.

Год назад Тартуский уездный суд на основании оценки Министерства внутренних дел не удовлетворил ходатайство Мухамедшина. Советник МВД по делам религий Ильмо Ау, ознакомившись с документами, тогда счел, что представленные материалы не соответствуют требованиям Закона о церквях и приходах, а также правилам эстонского языка. Например, министерству не понравилось название "муфтият", которое не характерно для эстонского языка.

Регистрация общины "Муфтият мусульман Эстонии" состоялась после того, как Тартуский уездный суд 12 февраля 2026 году удовлетворил жалобу представителей общины, аннулировал прежнее постановление отдела регистрации и направил поданное еще 3 апреля 2025 года заявление о внесении записи в отдел регистрации для принятия решения.

Суд в итоге не согласился с утверждением МВД, что название "Община "Муфтият мусульман Эстонии" вводит в заблуждение относительно целей, масштаба деятельности или организационно-правовой формы.

В марте 2024 года состоялось заседание совета мусульманской общины Эстонии, на котором Мухамедшин был отозван с поста главного священнослужителя в связи с нарушением финансовой дисциплины. В 2017 году прокуратура в ходе уголовного расследования установила, что главный имам Мухамедшин использовал деньги общины в личных целях. Прокуратура прекратила уголовное дело по принципу оппортунитета.