По версии российской прокуратуры, фонд "реализует программы и проекты, направленные на формирование протестных настроений и радикализацию молодежи, дискредитацию органов государственной власти России". Он также, как утверждается, "распространяет материалы и сообщения, выпускаемые иностранными агентами, а также иностранными и международными НПО, деятельность которых признана нежелательной в РФ", сообщила новостная служба Deutsche Welle.

До вторжения в Украину в России были представлены шесть немецких политических фондов, близких к партиям. Ранее власти РФ внесли уже в список "нежелательных " пять из них: Фонд им. Конрада Аденауэра, Фонд им. Генриха Бёлля, Фонд им. Фридриха Эберта, Фонд им. Фридриха Науманна и Фонд им. Ханнса Зайделя.

Фонд им. Дезидериуса Эразмуса, близкий к ультраправой партии "Альтернатива для Германии", пока не признан "нежелательным" в РФ, но у него нет и не было представительства в Москве.

Близкий к германской Левой партии Фонд им. Розы Люксембург основан в 1990 году. Согласно информации на его сайте, фонд поддерживает организации более чем в 80 странах, выступающие за права трудящихся, женщин, антифашистского и антивоенного движений, а также предоставляет стипендии иностранцам, обучающимся в университетах Германии.

Фонд имени Розы Люксембург не работает в России с апреля 2022 года. Тогда Минюст РФ исключил из реестра филиалов и представительств международных организаций и иностранных НКО филиал немецкого фонда  и 14 других международных организаций.

При этом на русском языке продолжает работать Фонд им. Розы Люксембург в Центральной Азии. Его представительство открыли в Алматы в 2019 году.