В Эстонии в День Европы вывешиваются флаги. Сегодня их можно видеть на всех государственных и муниципальных учреждениях, а также зданиях публично-правовых организаций.

Европейский флаг вместе с эстонским вывешивают Рийгикогу, правительство, президент, Государственый суд, Государственный контроль, канцлер юстиции, министерства, Банк Эстонии, Генеральный штаб и органы самоуправления.

Флаги вывешиваются с восходом солнца или не позднее восьми часов утра, а снимаются с закатом.

День Европы приурочен к подписанию декларации Шумана, которое состоялось 9 мая 1950 года. В декларации было предложено объединение сталелитейной и угольной промышленности Франции и Германии, что привело к созданию Европейского объединения угля и стали - первому Европейскому сообществу.

Несколькими годами позднее, в 1985 году в Милане Европейский совет утвердил 9 мая как день флага ЕС. Европейский парламент официально признал 9 мая праздником в октябре 2008 года.