По данным Департамента здоровья, на 44-й неделе к врачам обратились 2768 жителей Эстонии с симптомами вирусных инфекций верхних дыхательных путей Основными возбудителями были вирус SARS-CoV-2, а также рино-, грипп- и парагрипп-вирусы. Уровень заболеваемости инфекциями верхних дыхательных путей и гриппом остается низким, но имеет тенденцию к росту.

Средний показатель заболеваемости составил 202 случая на 100 000 населения. Выше среднего он был в Тартуском, Харьюском и Ляэнеском уездах. Распространение вирусов гриппа остается устойчивым, а темпы роста указывают на начало эпидемического распространения.

На 44-й неделе зарегистрировано 66 случаев гриппа. В Эстонии одновременно циркулируют два подтипа вируса гриппа А и вирус гриппа В (Victoria). Пока не ясно, какой штамм станет доминирующим.

По состоянию на 2 ноября 2025 года, охват вакцинацией против гриппа среди групп риска составляет 22%. По оценке экспертов ВОЗ и Европейского центра профилактики и контроля заболеваний (ECDC), риск тяжелых осложнений и госпитализаций, связанных с гриппом, можно существенно снизить, если охват вакцинацией в группах риска достигнет не менее 75%.

Заболеваемость Covid-19 в целом остается стабильной, однако наблюдается небольшой рост. Среди циркулирующих вариантов вируса не выявлено штаммов с более тяжелым течением болезни.

Широкое распространение респираторно-синцитиального вируса (RSV) пока не началось. С начала сезона (с 29 сентября 2025 года) зарегистрировано 12 случаев заболеваний, связанных с RS-вирусом.