В исследовании приняли участие 47 ученых, которые проанализировали почти 400 окуней из 29 стран. Ранее не проводилось столь масштабного и географически репрезентативного геномного исследования пресноводных рыб. Охватывающая большую часть Евразии сеть отбора проб позволила выявить как крупные пути миграции, так и тонкие различия между популяциями. Работа продолжает исследование, опубликованное в 2024 году, которое охватывало окуней из 10 разных стран, пишет профессор генетики и геномики рыб Эстонского университета естественных наук Анти Ваземяги, пишет ERR Novaator.

Ученые исследовали геномную вариацию рыб значительно более подробно, чем ранее. Предыдущие исследования, сосредоточенные на филогеографии окуня, то есть на распространении эволюционных линий, ограничивались короткими секвенированными фрагментами митохондриальной ДНК.

Новое исследование, однако, основано на секвенировании полного митохондриального генома. Рабочая группа проанализировала тысячи однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), присутствующих в ядерном геноме. По сути это означает участки, где генетический код рыб различался между собой всего на один-единственный строительный элемент ДНК.

Шесть эволюционных линий

Исследование подтвердило сделанное в 2024 году открытие, согласно которому регион Балтийского моря является одним из важнейших центров генетического разнообразия современного окуня. Это исключение, поскольку у многих других видов рыб и животных северные популяции генетически беднее южных.

Анализ геномов подтвердил, что в Евразии существует пять четко различимых эволюционных линий. Кроме того, ученые обнаружили в регионе Черного моря и Балкан новую, ранее не описанную генетическую линию. Также выяснилось, что бассейн Дуная населен генетически самой древней материнской линией окуня, которая отделилась от других примерно 1,4 млн лет назад.

"Из предыдущего исследования мы знали, что в регионе Балтийского моря есть три различные материнские линии. Обнаружение новой линии в регионе Черного моря и Балкан стало для нас неожиданностью. Это открытие является хорошим примером того, как масштабное ДНК-исследование позволяет более точно картографировать внутривидовую изменчивость", – пояснил первый автор работы, докторант кафедры аквакультуры Эстонского университета естественных наук Виталий Лихман.

В регионе Балтийского моря распространены материнские линии 2, 3 и 4, которые приходят с запада, юго-востока и востока. Линия номер 1 обитает преимущественно на территории современной России и Азии. Линия номер 5 четко различима и исторически распространена в Центральной и Юго-Восточной Европе (на территориях современной Швейцарии, южной Германии, Австрии, Боснии и Герцеговины, Сербии и Косово).

Новые знания о генетическом бэкграунде и путях миграции окуня в дальнейшем помогут изучать адаптационные способности рыб и более устойчиво управлять рыбными ресурсами. Статья, подготовленная на основании научной работы, опубликована в журнале Ecology & Evolution. Исследование финансировалось Эстонским научным агентством.